У еукаріотів і архей старт-кодон завжди кодує метіонін, а у бактерій і прокаріотів — модифікований метіонін (N-формілметіонін). Найбільш поширеним стартовим кодоном є AUG (Т. Е. ATG у відповідній послідовності ДНК).

Стандартні стоп–кодони – УАА, УАГ та УГА (UAA, UAG, UGA). Стоп–кодони виконують важливу функцію завершення (термінацію) складання поліпептидного ланцюга і також називають термінаторними кодонами.

Кодон (кодуючий тринуклеотид) – одиниця генетичного коду, трійка нуклеотидних залишків (триплет) у ДНК або РНК, зазвичай кодуючих включення однієї амінокислоти. Послідовність кодонів в гені визначає послідовність амінокислот в поліпептидному ланцюзі білка, що кодується цим геном.

Серед триплетів є 4 спеціальні послідовності, що виконують функції «розділових знаків». Триплет AUG, що також кодує метіонін, називається старт– кодоном. З цього кодону починається синтез молекули білка.