Напередодні дослідження рекомендовано прийом прозорих рідин. У пацієнтів із хронічними запорами підготовка починається за 5 днів до процедури. Якщо пацієнт користується проносними, він повинен продовжити їх прийом, а при тривалих запорах (до 6-7 днів) рекомендується збільшити дозу проносного вдвічі.

Процедура триває 5-20 хвилин (залежно від маніпуляцій, які необхідно провести)

Для підготовки кишки до її дослідження очищають за допомогою клізм (1,5-2 літри простої води температури тіла). Першу клізму бажано зробити напередодні дослідження ввечері, приблизно за 3-4 години до дослідження ставлять ще 2 клізми з перервою 45 хвилин.

Ендоскопічне дослідження виконується натщесерце, щоб уникнути випадкового закидання залишків їжі або рідини в дихальні шляхи при блювотних рухах або кашлі, тому останній прийом їжі повинен бути не пізніше 21 години напередодні дослідження. У день дослідження не їжте та не пийте до процедури.