Основною методикою діагностики хронічного пієлонефриту є рентгенологічне дослідження. Дані допомагають уточнити розмір, форму та розташування нирки. Також лікарем може бути призначена комп'ютерна томографія та ультразвукові дослідження.

До основних симптомів хронічного пієлонефриту у чоловіків та жінок відносять:

• Зниження апетиту
• Слабкість
• Прискорене сечовипускання
• Ниючі болі в області попереку
• Головні болі

Діагноз встановлюється за наявності в сечі лейкоцитів (лейкоцитурії) та бактерій (бактеріурії). Для підтвердження факту хвороби доведеться пройти ультразвукове дослідження нирок, рентгенографію та виконати загальний аналіз крові та сечі.

Діагноз ставлять, якщо мікробна колонізація в сечі становить більше 104 колонієутворюючих одиниць мікроорганізмів в 1 мл сечі та/або мікробна інвазія з розвитком інфекційного процесу спостерігається в будь-якій частині сечостатевого тракту від зовнішнього отвору уретри до кіркової речовини нирок.